設定PH控制器之前需要測試水質的KH值，然后通過下表去確定合適的PH值：
要注意，此表為考慮干擾因子，因此在實際使用中，應該將設定值向左側推2~3格(也就是實際設定值比比標準值要低)。
如果沒有KH測試劑也可以用簡單的方法進行調整，一般來說，在水質不是太硬的情況下(GH=2~8)，設定值可以比不加CO2時的測量值低0.4~0.8，水質越硬，變化應該越小，當GH值大于20時，建議放棄使用PH控制器，此時PH值受CO2濃度影響太小，控制誤差太大。
設定PH控制器PH值需要先將“PHSET”開關撥到SET位置，然后用調整桿調節“SET”孔內的旋鈕，直到顯示數值達到期望值。調整完畢后要將“PHSET”開關撥回到“PH”位置。
PH控制器調整完畢后，需要經過一定時間在進行觀察和調整(水體容積越大，等待時間越久)~注意觀察PH值是否和設定值相等，如果長時間不能相等，那么多半是CO2系統的溶解速率不夠所致~請將CO2系統的供氣量增加到該系統所能溶解的zui大供氣量略低，CO2系統的溶解能力越強，控制精度越高。
PH控制器的安裝的一般要求，要是本儀器長期穩定運行，PH控制器應安裝在溫度穩定，避免風吹、日曬、雨淋和強輻射)，無明顯沖擊和振動、無強烈腐蝕性氣體，無外界強電磁場干擾、大量粉塵等地方。同時為了檢測滯后，一起盡可能地靠近取樣點，外殼要可靠接地。對零氣樣和被測的樣氣，均需按儀器的要求進行嚴格的處理。
PH控制器的光路平衡調整
兩束紅外線能量相等的標志是儀表指示值zui小，為了檢查光路平衡是否調整好，可通過“狀態檢查”按鈕進行，當按下“狀態按鈕”時，工作邊光源電流將被分流一部分，是工作邊光能量減小，這相當于給了一個固定的信號，PH控制器指示應由小到大，單方向偏轉，說明“光路平衡”已調好若出現指示針向減小方向偏轉，而后又向增大方向偏轉，及出現了“回程”現象，說明“光路平衡”沒有調好，應重新調整，知道不出現“回程‘現象為止。
由檢測器的檢測原理可知，PH控制器輸出電壓U=f(△C)，只要I工作≠I參比，不論哪一個大，儀表都有一個指示值。設儀表通零所示時I工作> I參比，如圖曲線中A位置，儀表有一個指示值，而當儀表改通被測組分濃度大于零的樣氣，I工作逐漸減小，指示值沿著曲線。
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